内蒙古农业大学职业技术学院成立于1985年，是自治区建立最早的一所培养高等技术应用型专门人才的职业技术学院，2009年经自治区机构编制委员会批准，学院升格为准厅级单位。1985年内蒙古农牧干校划归内蒙古农牧学院，内蒙古农牧学院分院正式成立；1997年经教育部批准，学院命名为内蒙古农牧学院职业技术学院；1999年内蒙古农业大学成立，学院更名为内蒙古农业大学职业技术学院。
学院坐落于包头市土默特右旗，占地面积5000余亩，建筑面积20余万平方米，固定资产总值31120.58万元，教学仪器设备总值7248万元。现有园艺园林技术系、畜牧兽医技术系、食品工程技术系、经济管理系、建筑工程技术系、计算机技术与信息管理系、艺术设计系、车辆工程技术系、旅游管理系、基础课教学部、体育教学部共11个教学单位。截至2016年9月，学院本专科招生专业56个（其中本科专业20个，专科专业36个），园艺技术专业是全国高职教育“精品专业”，园艺技术专业与畜牧兽医专业被教育部确定为全国高职教育教学改革试点专业；食品加工技术、畜牧兽医、园艺技术、计算机网络技术、食品营养与检测、园林技术、旅游管理、食品生物技术、计算机信息管理、会计等10个专业先后被确定为自治区级品牌专业，畜牧兽医（运动马驯养与管理方向）是我院特色专业方向，有12门课程被确定为自治区级精品课程。学院有教职工492人，其中专任教师325人,有2个自治区级教学团队，11个校级教学团队；1名教师被评为“自治区优秀教师”,3名教师被评为“自治区教学名师”，3名教师被评为“自治区教坛新秀”，2人入选自治区“511人才培养工程”，学院全日制在校生达7037人。学院是“内蒙古自治区示范性职业技术学院立项建设单位”，是科技部、中宣部等部委联合命名的“全国青少年科技教育基地”、“全国科普教育基地”，是自治区党委、政府命名的自治区“文明单位标兵”，是“内蒙古农牧业科技园区”的承办单位，是国家职业技能鉴定站、计算机定点考试站、ITAT培训基地，是内蒙古人力资源与社会保障厅批准的职业技术等级培训定点单位。学院获得了“全国职业教育先进单位”、“全国教育系统先进集体”、“全国科普惠农兴村先进单位”、“中国教育创新示范单位”、自治区“先进基层党组织”等多项荣誉称号。2006年学院在教育部组织的高职高专人才培养工作水平评估中被评为“优秀”。
学院全面贯彻党的教育方针，主动适应自治区经济建设和社会发展需要，不断深化教育教学改革，《高等职业技术教育人才培养模式的研究与实践》和《以多功能可持续实训基地为平台，创新“全程定岗、四步实训”实践教学体系》教学研究成果获国家教学成果二等奖、自治区教学成果一等奖；《高等职业技术教育“目标跟踪式”人才培养模式研究与实践》和《高职教育“实践导向,阶梯培养”双师型教师队伍建设模式的创新与实践》教学研究成果获“自治区教学成果二等奖”，学院被批准为“自治区园艺、畜牧职教师资培训基地”。
学院建成了14个功能较为齐全、规模较大的校内实训基地，通过校企和对外交流合作，建立了92个相对稳定的校外实训基地，与加拿大北阿尔伯特理工学院和EUC开展合作办学，开展了教师海外培训、学生海外实习等工作。与香港赛马会、法国马业协会、中国马业协会和多家国内外马术俱乐部保持密切合作的办学关系，与内蒙古文化厅、内蒙古射击射箭马术运动管理中心签署了合作办学协议，与中国马业协会和内蒙古文化厅签署了内蒙古运动马学院共建框架协议，与土默特右旗人民政府共建敕勒川现代农业绿色博览园。学院毕业生近五年就业率保持在97%以上。在实现人才培养、科学研究、社会服务、文化传承等方面取得了显著成效。
经过30多年的建设和发展，学院已成为在全国同类院校中具有鲜明地区特点和民族特色，具有专业学位研究生、本科生、专科生多个培养层次的专业教育优势，以农牧类专业为主，工、经、管、文等专业协调发展的高职院校。建院以来，为自治区培养了大批面向生产、建设、管理、服务第一线的高等技术应用型专门人才，为自治区的经济建设和社会发展做出了积极贡献。