株洲市首个“二代+三代”新冠病毒全基因测序实验室成功建成
近日，市疾控中心按照国家下发的《我国人群新冠病毒变异株监测工作方案》工作要求，首次从哨点医院收集门诊、住院患者样本进行新冠病毒全基因组测序获得成功，标志着全市首个“二代+三代”新冠病毒全基因测序实验室成功建立。
在市疾控中心实验室，工作人员正在使用二代测序平台对样本试剂进行上机测序。病原体的全基因组测序主要是利用二代、三代测序技术平台，对病原基因组序列进行完全测定，通过对基因序列的深入分析，揭示病原微生物在基因组层面的变化，解释病毒的来源、传播、变异演化等问题。目前，市疾控中心已经具备二代高通量测序仪和三代纳米孔测序仪，将高效助力我市新冠病毒变异株的监测工作，株洲也成为全省少数同时具备二代和三代新冠病毒全基因测序平台的地级市。
市疾控中心微生物检验科科长 曹正安： 二代测序可以做到边合成边测序，三代测序是基于纳米孔测序，可以做到边测序边分析，能够快速准确地对新冠疫情做追踪溯源。
据了解，市疾控中心已基于二代、三代测序平台开展多批次新冠病毒全基因组测序，分析结果显示，我市当前疫情主要流行株为奥密克戎BA.5.2和BF.7两种变异株，其中BA.5.2仍然是主要流行毒株。目前尚未发现传播力、致病力和免疫逃逸能力具有明显变化的奥密克戎新毒株。
市疾控中心微生物检验科科长 曹正安： 我们根据国家新冠变异株监测的工作要求，每个月从哨点医院收集重症病例、死亡病例等新冠标本，每月定期开展新冠病毒测序监测，通过结果及时追踪病毒变异情况，为国家进行新冠疫情防控策略提供科学依据。
记者|孙玮萱,张巍